Jumpcode GenomicsとTGenは、SARS-CoV-2のゲノム配列決定で協力しています

by REVOLUSYNAPSE
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人間生物学の理解を深めることに焦点を当てたゲノム技術プラットフォーム企業であるJumpcodeGenomicsは本日、SARS-CoV-のゲノム疫学の調査を支援するために、City ofHopeの関連会社であるTranslationalGenomics Research Institute(TGen)とのコラボレーションを発表しました。 2、COVID-19を引き起こすウイルス。 Jumpcode GenomicsとTGenは、メタゲノムシーケンスと分析を活用してCOVID-19やその他の感染症の検出を容易にする、新しい包括的なソリューションと臨床サービスを検証しています。 Jumpcode GenomicsCRISPRclean™テクノロジーを使用することで、すべてが非常に効率的になりました。

COVID-19は、米国で66万人以上の死者を出し、新しい亜種によって引き起こされる症例は着実に増加しています。 SARS-CoV-2感染の診断、COVID疾患の患者リスクの評価、コミュニティ内の感染の数と原因の追跡は、新しいCOVID-19の症例を軽減および予防するために重要ですが、正確かつ効率的に行うことは困難です。 州、地方、および地域の保健部門からCOVID-19症例データを収集するための全国監視プログラムが進行中ですが、疾病管理予防センターに報告された症例は、無症候性で軽度の症例による感染の実際の数を過小評価しています。テストを受ける。

SARS-CoV-2のゲノム配列決定は、感染の診断、ウイルスおよび関連ウイルスの新しい変異体の特定済、既存の菌株の蔓延の追跡、および将来の感染症の発生を防ぐための公衆衛生の取り組みの通知に重要な役割を果たすことができます。 メタゲノムシーケンシングを強化するためにJumpcodeのCRISPRcleanテクノロジーを使用することで、SARS-CoV-2感染だけでなく、あらゆる同時感染、および/または感染に対する関連するヒト宿主の反応を検出することができます。」

Nicholas Schork、Ph.D.、TGen Distinguished Professor and Director of TGen’s Quantitative Medicine and Systems Biology Division

Jumpcodeは、CRISPRベースのテクノロジーと次世代シーケンスを組み合わせて不要なシーケンスを削除することで、感度を高め、より効率的で費用効果の高いシーケンスを可能にします。 このアプローチにより、科学者はより良いデータを取得し、感染の性質に関するより関連性の高い情報を抽出し、最終的には検出されなかったであろう感染の固有の側面を特定済することができます。 TGenは、JumpcodeのCRISPRcleanを介した枯渇の可能性をテストしています 試薬 CRISPRclean試薬を使用して診断アッセイを実施するためのプロトコルや、結果として得られるメタゲノム配列データを分析するためのアルゴリズムなど、Schork博士の研究室の技術と組み合わせて使用​​します。 拡張された前向き臨床および疫学研究は、感染症の日常的な患者検査における診断アッセイの有用性を証明するために計画されています。

JumpcodeとTGenが採用したアプローチの側面は、感染状況と感染の重症度がわかっている一連の参照サンプルを使用して最近検証されました。 現在、TGenの研究者は、PCRテストによって以前に評価されたCOVID-19サンプルを研究して、標準的な焦点を絞ったPCRベースのテストに対するメタゲノム診断の感度と特異性を評価しています。 TGenの研究者は、SARS-CoV-2感染が見つかった個人の重複感染の可能性も特定済することができました。

「COVID-19パンデミックは前例のない方法で私たちの生活のすべてに影響を与えました。それでも、感染のポイントとそれがどのように広がるかについて学ぶべきことがまだたくさんあります」とジャンプコードゲノミクスのCEOであるYaronHakak博士は言いました。 「TGenの科学者たちは、COVID-19の検査、診断、治療に関する最も革新的な研究のいくつかを主導してきました。さらに、TGenはアリゾナ州の州の配列検査の大部分を担当しており、これについて彼らと協力できることを誇りに思います。メタゲノムプロジェクト。これらの取り組みから得られた知識は、公衆衛生の専門家がCOVID-19の新種の影響を軽減し、将来のパンデミックに備えるのに役立つ可能性があります。」

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