鼻咽頭スワブの代わりに天然温泉水うがいを使用したSARS-CoV-2検出

by REVOLUSYNAPSE
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カナダのケベック州は、2020年2月末にかけてコロナウイルス病2019(COVID-19)のパンデミックに見舞われ、これにより前例のない方法で医療ネットワークが動員されました。 ケベックの研究所ネットワークは、Laboratoire de sante publique du Quebec(LSPQ)による社内の核酸増幅検査(NAAT)の開発により、毎日39,000の検査を提供することができました。

ケベック州の医療制度は、パンデミックの第2波と第3波の間にCOVID-19症例が指数関数的に増加したため、緊張状態に置かれました。 症例の増加により、テストの必要性が高まり、大規模なテストのレベルを維持するためにいくつかの戦略が必要になりました。

勉強: 実験室で開発されたテストを使用したSARS-CoV-2検出のための鼻咽頭スワブの代替としての天然温泉水うがいサンプル。 画像クレジット:Cryptographer / Shutterstock.com

最も推奨される試験方法は、経口および 鼻咽頭スワブ (ONPS); ただし、このサンプリング方法は侵襲的であり、訓練を受けた専門家が必要です。 唾液やうがい薬を利用する方法など、いくつかの代替試験方法が提案されています。

唾液法の研究は高い感度を示しています。 しかし、一部の人が生成する唾液の量に問題がありました。 さまざまな機関の研究者チームが、実験室で開発されたテストで、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)を検出するためのONPSの代替としての湧水うがい(SWG)の使用を検証しました。

研究について

ONPSと比較した場合、SWGからの実験室で開発されたNAAT(LD-NAAT)の臨床感度は有意に低かった。 年齢、場所、接触歴、またはCOVID-19と互換性のある症状を含むこの研究のさまざまなサブグループ間で、感度の違いは大きく異なりました。

著者らはさらに、症状の持続期間に従って患者を細分化し、検査の感度は、検査の3日以内に症状を示した患者間で類似していることを明らかにしました。 比較すると、検査の少なくとも7日前に症候性であった患者では、35.7%の違いが観察されました。

0.93から0.96まで変化するカッパ値で示されるように、3つのコンパレーターアッセイとの一致は優れていました。 熱溶解を使用した場合と比較して、化学抽出後にLD-NAATを介して検出された陽性SWGサンプルが多かった。

すべてのSWGサンプルのうち、18個がSimplexa COVID-19DirectアッセイおよびLD-NAATで陽性であることが示されました。 LD-NAATをcobasSARS-CoV-2テストと比較した場合、陽性率の一致は90.7%でした。

平均コンパレータサイクルしきい値(Ct)値は、一致して正のSWGサンプルよりも不一致のサンプルで有意に高かった。 SWGサンプルと比較した場合、ONPSの陽性サンプルの平均Ct値ははるかに低かった。

2つのサンプルタイプのΔCtの間にかなりのばらつきが観察され、一致する陽性サンプル間の平均ΔCtは6.7でした。 不一致のペアのサンプルと比較した場合、ペアの一致したサンプルは、はるかに低い平均ONPSCt値を示しました。

含意

この研究の結果は、熱溶解が先行する実験室で開発されたテストでテストされた場合、SWGはONPSよりも感度の低いサンプリング方法であることを示しています。 ただし、ウイルスリボ核酸(RNA)の量が少ないサンプルは、通常、この臨床感度の低下を示すサンプルです。

SWGは非侵襲的な方法であるため、感度の低下は、より高い受容性によって補われる可能性があり、その結果、人口ベースの観点でより高い検出率が得られる可能性があります。 ただし、患者にCOVID-19の疑いが高い場合は、ONPSによる繰り返し検査を検討する必要があります。



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